截至目前（2018.6.10），以下方法亲测有效，完成caffe编译，pycaffe编译，python3成功import caffe无报错
配置：VirtualBox + Ubuntu16.04 LTS + python3.5（系统自带）+ caffe在虚拟机上安装好Ubuntu16.04后点击屏幕上端的工具栏，点击设备-->安装增强功能...-->运行，会出现终端自动执行命令，按提示点击回车
共享粘贴板：
点击 设备-->共享粘贴板-->双向共享文件：
点击 设备-->共享文件夹-->共享文件夹... 出现如下窗口
点击右侧图标，选择共享文件夹路径，勾选自动挂载，点击OK
重启系统，此时会出现名字为“sf_{共享文件夹}”的文件夹，这就是和主机共享的文件夹，但Ubuntu对此没有访问权限，想获取权限的话需打开终端，输入： sudo usermod -a -G vboxsf {yourusernanme} 重启即可获得访问共享文件的权限
Ubuntu16默认的python版本是2.7，如果想要把默认版本切换成3.5，做如下操作（如果不换默认版本，跳过这一步），打开终端输入：
sudo update-alternatives --install /usr/bin/python python /usr/bin/python2 100sudo update-alternatives --install /usr/bin/python python /usr/bin/python3 150
即可完成python版本的切换，如需切换回2.7，可输入：
sudo update-alternatives --config python
按提示选择python版本
或者使用Ubuntu默认设置，即用2.7输入python，用3.5输入python3，本环境使用的是3.5，因此用python3
安装caffe:
首先安装依赖库：sudo apt-get install libprotobuf-dev sudo apt-get install libleveldb-devsudo apt-get install libsnappy-dev sudo apt-get install libopencv-devsudo apt-get install libhdf5-serial-devsudo apt-get install protobuf-compilersudo apt-get install libatlas-base-dev（sudo apt-get install libopenblas-dev）sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
若中间出现“由于已经达到 MaxReports 限制，没有写入 apport 报告”的问题，解决方法如下：
cd /var/lib/dpkg sudo mv info/ info-bak sudo mkdir info sudo apt-get update sudo apt-get install -f
恢复info-bak：
sudo mv info/* info-bak/ sudo rm -rf info sudo mv info-bak/ info
建立pycaffe接口：
sudo apt-get install python-devsudo apt-get install python3-dev
及相关依赖库
sudo apt-get install libgflags-dev sudo apt-get install libgoogle-glog-dev sudo apt-get install liblmdb-dev
下载caffe源码：
首先安装gitsudo apt-get install git
下载caffe源码：
git clone https://github.com/BVLC/caffe.git
安装pip3:
wget https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py sudo python3 get-pip.py
安装相关的Python包：
cd caffe/pythongedit requirements.txtpython-dateutil 版本改成 python-dateutil>=2.5for req in $(cat requirements.txt); do sudo -H pip3 install $req; done
题外话，如果在anaconda3环境下使用conda若出现permission denided，解决方法如下：
sudo chown -R {username}:{username} /home/{username}/anaconda3 编译caffe源码：
cd ..cp Makefile.config.example Makefile.config
修改Makefile.config文件内容：
gedit Makefile.config
修改内容如下：
取消 CPU_ONLY := 1 前的‘#’取消 WITH_PYTHON_LAYER := 1 前的‘#’
修改：
INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial
根据你的python版本修改如下内容：
# NOTE: this is required only if you will compile the python interface.# We need to be able to find Python.h and numpy/arrayobject.h.#PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python2.7 \# /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include# Anaconda Python distribution is quite popular. Include path:# Verify anaconda location, sometimes it's in root.# ANACONDA_HOME := $(HOME)/anaconda# PYTHON_INCLUDE := $(ANACONDA_HOME)/include \ # $(ANACONDA_HOME)/include/python2.7 \ # $(ANACONDA_HOME)/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include# Uncomment to use Python 3 (default is Python 2) PYTHON_LIBRARIES := boost_python3 python3.5m （Ubuntu自带为python3.5,因此将这三行取消注释，将上面2.7的部分注释；如果用的是anaconda，则将2.7和3.5都注释，然后修改ANACONDA_HOME的路径为anaconda安装路径，并取消注释） PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python3.5m \ /usr/local/lib/python3.5/dist-packages/numpy/core/include# We need to be able to find libpythonX.X.so or .dylib.PYTHON_LIB := /usr/lib# PYTHON_LIB := $(ANACONDA_HOME)/lib （使用anaconda时这里取消注释，并将上一句注释）
接下来编译caffe源码：
make pycaffe如果遇到：cannot find -lboost_python3
因为在配置文件的第 74 行中有 PYTHON_LIBRARIES := boost_python3 ，但是在系统中无法找到 boost_python3.lib 这个库文件。
解决方案如下：
检查是否有如下文件：
ls /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py35.so
如果有，说明我们的系统中已经有了这种库文件，只是文件名不同。
cd /usr/lib/x86_64-linux-gnu/sudo ln -s libboost_python-py35.so libboost_python3.so
遇到：
python/caffe/_caffe.cpp:10:31: fatal error: numpy/arrayobject.h: No such file or directory
解决方法是：
gedit Makefile.config PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python3.5m \ /usr/lib/python3.5/dist-packages/numpy/core/include
修改为：
PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python3.5m \ /usr/local/lib/python3.5/dist-packages/numpy/core/include
cd至caffe目录下，开始编译，中间如果报错，都要先make clean一遍再从头开始编译：
sudo make allsudo make testsudo make runtest
如果想在命令后加入 -jx (x为CPU数)加快编译速度，当sudo make runtest -j2时可能会报错:
BenchmarkTest/0.TestTimerMilliSeconds, where TypeParam = caffe::CPUDevice
或者
BenchmarkTest/1.TestTimerMilliSeconds, where TypeParam = caffe::CPUDevice
解决方法，在当前路径下：
export MKL_CBWR=AUTO
编译成功后，输入：
cd python （这里必须cd到/caffe/python下才能操作，如果想在任何路径下都能import caffe成功，则需添加环境变量，自行百度）python3import caffe
不报错即编译成功